CONCORSO A N. 2 CONTRATTI DI RICERCA, GRUPPI 01/INFO-01, 09/IINF-05, 09/IBIO-01, 13/STAT-01, 02/PHYS-02, CENTRO BIDSA, UNIVERSITA’ BOCCONI, PROGETTO FIS 3
Gruppo Scientifico-Disciplinare
01/INFO-01 - Informatica, 02/PHYS-02 - Fisica Teorica delle Interazioni Fondamentali, Modelli, Metodi Matematici e Applicazioni, 09/IBIO-01 - Bioingegneria, 09/IINF-05 - Sistemi di Elaborazione delle Informazioni, 13/STAT-01 - Statistica
Descrizione
Il progetto DECODE sviluppa un framework computazionale basato su transformer per integrare dati scRNA-seq e scATAC-seq e costruire modelli di regolazione genica. Include due moduli per singola omica (espressione genica e accessibilità cromatinica) e un modello cross-modale per inferire reti di regolazione (GRN), sfruttando un meccanismo di attenzione efficiente. Le applicazioni riguardano il sistema immunitario umano (ematopoiesi e linfociti T) e il tumore al seno triplo negativo, con focus su meccanismi regolatori e resistenza terapeutica. Il progetto prevede validazione sperimentale tramite CRISPR e sviluppo di strumenti di benchmarking. I ricercatori contribuiranno a progettazione, training e ottimizzazione dei modelli su larga scala, utilizzando dataset pubblici e infrastrutture HPC. Parteciperanno inoltre alla ricerca interdisciplinare, pubblicazioni, collaborazioni internazionali e sviluppo di software open source.
Sito web del bando
Numero posti
2
Ente finanziatore
Bocconi University
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