AIRC IG27350 - Role of the gut microbiome in the outcome of diffuse large B-cell lymphoma patients treated with CAR-T cell therapy

Gruppo Scientifico-Disciplinare

03/CHEM-07 - Chimica Farmaceutica, Tossicologica, Nutraceutico-Alimentare, delle Fermentazioni e Dei Prodotti per Il Benessere e per La Salute

Descrizione

Centralizzazione e Analisi dei Campioni In continuità con le attività dell’anno precedente, ho centralizzato nuovi campioni biologici da pazienti recentemente arruolati, tracciandoli, conservandoli e registrandoli presso la Human Microbiomics Unit. È stato estratto il DNA fecale e sequenziata la regione V3–V4 del gene 16S rRNA per profilare la diversità del microbiota intestinale. Per 132 campioni raccolti in precedenza, è stato effettuato sequenziamento metagenomico shotgun ad alta profondità, con controllo qualità e preprocessing. Le pipeline bioinformatiche hanno permesso profilazioni a livello di specie e ceppo e la ricostruzione di genomi batterici paziente-specifici (MAGs). Analisi funzionali hanno individuato potenziali geni driver associati agli outcome clinici, con focus su vie metaboliche e geni di resistenza agli antibiotici.

Sito web del bando

https://bandi.unibo.it/ricerca/Incarichi-di-ricerca

Ente finanziatore

ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA - - DIPARTIMENTO DI SCIENZE MEDICHE E CHIRURGICHE

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