Sviluppo e ottimizzazione HPC di metodi di molecular docking fisicamente informati per virtual screening su scala estrema - 2026_IDR_DEIB_46
Gruppo Scientifico-Disciplinare
09/IINF-05 - Sistemi di Elaborazione delle Informazioni
Descrizione
Il progetto riguarda lo sviluppo di una applicazione avanzata a supporto del drug discovery, con particolare riferimento al molecular docking e al virtual screening ad altissima efficienza. L’obiettivo è estendere approcci di docking attualmente basati soprattutto su criteri geometrici mediante l’integrazione di interazioni chimico-fisiche, migliorando la predizione delle pose di legame e la selezione dei candidati molecolari.Le attività includono l’analisi, lo sviluppo e l’ottimizzazione della pipeline di molecular docking, con attenzione a portabilità e prestazioni su architetture HPC eterogenee. Il progetto prevede porting e ottimizzazione in C++/CUDA/SYCL, con sperimentazione su muDock, applicazione open source, e LiGen, software proprietario di Dompé Farmaceutici. L’obiettivo finale è abilitare campagne di virtual screening high-throughput su scala estrema, fino a miliardi di molecole.
Sito web del bando
Numero posti
1
Ente finanziatore
Politecnico di Milano
Modalità di selezione
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