Genotipizzazione accurata e analisi dell’espressione tessuto-specifica del genoma mitocondriale umano mediante integrazione di dati WGS e dRNA-Seq

Questo studio introduce un approccio integrato e scalabile che combina sequenziamento dell’intero genoma (WGS) e sequenziamento diretto dell’RNA a lettura lunga (dRNA-seq) per una caratterizzazione ad alta risoluzione del genoma mitocondriale umano. Il metodo comprende l’applicazione di MitSorter, uno strumento che sfrutta le differenze epigenetiche tra mtDNA e NUMTs per distinguere accuratamente le letture, superando i limiti delle tecnologie short-read. L’analisi di 73 campioni provenienti da 15 tessuti potrà consentire una genotipizzazione affidabile e una valutazione dell’espressione tessuto-specifica. Il sequenziamento long-read permetterà inoltre di studiare trascritti completi, processi di maturazione dell’RNA e modificazioni post-trascrizionali. L’integrazione dei dati genomici e trascrittomici potrà collegare varianti mitocondriali alla loro espressione, rivelando firme regolative specifiche di tessuto.